Leider akzeptiert der Hoster, wo Du das File hochgeladen hat, nicht dass man es dort herunterladen kann, deswegen kann ich es nicht selber probieren.
Die einfachste Möglichkeit für Dich wäre das Umwandeln bereits beim Herunterladen zu konvertieren. Das kann der JDownloader für Dich erledigen, ich nehme mal an dass Du das Programm kennst. Als Ausgabeformat kannst Du z.B. mp4 auswählen.
Ob
Avidemux swf-Files auch verarbeiten kann weiß ich nicht, habe ich noch nicht versucht, aber das Programm frisst ansonsten eigentlich alles. Das wäre mein zweiter Vorschlag für Dich.